Prestasi Madrasah

Prestasi MAN Yogyakarta III

1. Perpustakaan terbaik nasional
2. Sekolah Sehat Nasional
3. Adiwiyata Nasional
4. Kerjasama Sister School : Man Insan Cendikia Serpong, SAMT Malaysia, Madrasah Wak Tanjong Singapura, UTTC Thailand, Sekolah Sultan Alamsyah Putrajaya Malaysia.